2009年、地球人類は初めて異星人と接触。その異星人、ゼントラーディという名の巨人の軍隊と宇宙戦争に突入し、地球は滅亡の危機に瀕した。
2010年3月、戦争終結。同年4月、新統合政府が樹立され、地球人類と異星人ゼントラーディは、共存の道を歩み始めた。希望するゼントラーディは、マイクローン化という技術により、その身体を地球人サイズに変えた。
2011年9月、地球統合政府は種の存続を主眼におき、人類移住計画を立案。翌年9月、第1次超長距離移民船団メガロード1が出航した。
2021年12月、前澤友作を乗せたシャトルが地球を飛び立ち、消息を断つ。
2030年9月、メガロード級大型移民船に代わり、超大型移民船の新マクロス級1番艦が出航、100万人規模の移民船団となった。
2038年、新マクロス級7番艦を中核とした、第37次超長距離移民船団マクロス7出航。銀河の中心へと向かい旅立った。

そして2 0 4 5 年・・・