端からでも良いから、地道に駆除していくしかないのでは？
ミントは地中に横方向に根を伸ばしていくから難しいけど
とりあえず適当に範囲を決めて、深く掘って区画を作って
完全に駆除したい区画にシートを敷いて太陽光と水を断ち切るとか