時は大海賊時代。いまや伝説の海賊王ゴールド・ロジャーが遺した「ひとつなぎの大秘宝（ワンピース）」をめぐって、海賊が壮絶な戦いを繰り広げていた…
海賊に憧れる少年ルフィは幼い頃、村に滞在していた大海賊“赤髪のシャンクス”の戦利品「悪魔の実」を食べてしまい、体が伸びるゴムゴムの能力と引き替えに、一生泳げない体になってしまった。そして、シャンクスと敵対する山賊団の怒りを買い、海に投げ込まれてしまう。

溺れるルフィを海獣が襲おうとした瞬間、彼を救ったのはシャンクスだった！その片腕を犠牲にして…
「お前がいつか立派な海賊になったら、この帽子を俺のところに返しに来い」
それから１０年。シャンクスから受け継いだ麦わら帽子をトレードマークに、ルフィは一人夢に向かって大海原へと漕ぎ出した。航海の途中出会った、三刀流の達人・ゾロ、元女盗賊の航海士・ナミ、パチンコの名手・ウソップ、料理と足技の達人・サンジ、

医術に秀でた青っ鼻のトナカイ・チョッパー、謎多き考古学者・ロビン、機械人間の船大工・フランキー、アフロなガイコツ剣士の音楽家・ブルックを仲間に加え、ルフィ海賊団は“偉大なる航路（グランドライン）”をサウザンド・サニー号で突き進む。

しかし今回、海賊王と並ぶ世界最強の男・悪魔の実の能力者“金獅子のシキ”がルフィ海賊団の前に立ちはだかる！！